Manuel Martín Cuenca nace en Almería en 1964. En 1988 comienza a trabajar en cine como ayudante de dirección, script y director de reparto, colaborando con directores como Felipe Vega, Alain Tanner, Mariano Barroso, Iciar Bollaín o José Luis Borau, entre otros.

En 1999 empieza a escribir y dirigir sus propias películas tanto en el género documental como en la ficción. Durante esos años trabaja también como profesor de dirección e interpretación en diferentes escuelas de cine en España y Cuba, tales como Escuela Internacional de Cine de San Antonio de los Baños (Cuba), Escuela de Cine y Audiovisual de Madrid (ECAM) y la Universidad Carlos III, entre otras.

En 2004 crea su propia productora, La Loma Blanca P. C., con la que produce sus cinco últimas obras:  las películas de ficción La Hija actualmente en postproducción, El Autor (2017) , que gana el premio FIPRESCI de la crítica en el Festival de Cine de Toronto y tiene nueve nominaciones a los premios Goya ganando el Goya a Mejor Actor Protagonista y Actriz de Reparto, Caníbal (2013) película que se alza con el Goya a Mejor Fotografía y la Concha del Festival de San Sebastián a Mejor Fotografía y La mitad de Oscar (2011) así como el documental experimental La Cara B: El otro lado (2015).

Martín Cuenca ha dirigido además los films: El Juego de Cuba (2001), La Flaqueza del Bolchevique (2003), Malas Temporadas (2005), El tesoro –TV Movie- (2007) y Últimos testigos: Carrillo, comunista (2009), entre otros.